前沿论述 | Nature Microbiology:肺微生物群与COVID-19的严重程度
2025-02-14 创业
详尽的告诉,创作者适用了静脉镜(bronchoscopy)对COVID-19医务人员病患者的下肠胃部展开抽样,辨认出下肠胃部特定胸部的质药理学和流感病毒学特质可以表述HIV储存量(viral load)和病理情节的转变。令人遗憾的是,在COVID-19深入研究当年,静脉镜检是一种非常罕见的步骤。这些新辨认出声称,该领域在表述SARS-CoV-2发作;也统欠缺之处的主要死角之一是我们仍未这样一来时域和深入研究淋巴空隙。SARS-CoV-2受到感染引来的病理异质开放性是这种冠状HIV事与愿违沦为大风靡流感病毒的关键性。一欠缺之处,如果SARS-CoV-2受到感染的可怕开放性更为明确,可能会更容易控制,因为住院治疗病患者排斥于自我隔离,而遇害的病患者实际上是非传染开放性的。而另一欠缺之处,如果受到感染普遍更为更为更为严重,SARS-CoV-2将只是另一种季节开放性都可感冒(common cold)冠状HIV。SARS-CoV-2的急剧流行起来及其在世界各地区的持续不存在,部分原因在于它似乎兼具随机能力,可以让大多数细胞内受到感染无症状或更为更为严重的哮喘 (确保了广泛流行起来),同时引发少数差一点的人造成了可怕的肠胃部损伤。
随着我们对SARS-CoV-2深入研究的深入,HIV受到感染引来的病理异质开放性仍必须完全部都是表述。从风靡病学的大体上高度来看,老年人、共病和高社会生活经济地位会减小更为严重哮喘或遇害的后果。全部都是DNA三组相似之处深入研究(Genome-wide association studies)现在考虑到到了几个与更为严重哮喘欠缺之处的DNA位点2,外周血红血球流感病毒遗传显示流感病毒变异兼具合理的临床表现和病理状况因素意味3。然而,COVID-19病理更为严重程度的病患者高度转变在很大程度上仍然无法表述。
住院治疗COVID-19首先是一种HIV开放性肠胃炎,可引来下肠胃部上皮和内皮损伤。差一点的是,淋巴空隙的时域是兼具终究开放性的,因为淋巴空隙是哮喘发作的主要胸部。几十年来,最感兴趣和一些有反馈的步骤 (在Sulaiman等人的深入研究当年适用) 依然是适用静脉镜检查。这最主要通过喉部插入一根细而轻松的管子到下肠胃部,在那里它可以用来时域老是道 (通过擦漆) 和淋巴紧致 (通过静脉淋巴灌洗) (上图1)。在SARS-CoV-2大风靡后期,大多数病理当年心和深入研究人员选项可避免对COVID-19病患者展开静脉镜检查,因为担心HIV可控和随后减小的流行起来后果。因此,当年完全部都是所有关于SARS-CoV-2受到感染药理学的人类深入研究都没采自肠胃部检验。显然,文献当年主要是适用体内、咽漆子和其他更方便的骨头并不一定的深入研究。
上图1 在SARS-CoV-2受到感染当年,这样一来抽样肠胃部的最重要开放性被忽视。在人的下肠胃部时域的规格步骤是静脉镜,其当年淋巴紧致可以通过盐水灌洗时域。由于担心可控和流行起来后果,COVID-19病患者已可避免适用静脉镜检查,转而适用替代测量 (事例如,从体内和咽漆子)。Sulaiman等人的深入研究概述了这种步骤的欠缺。在COVID-19医务人员病患者当年,下肠胃部特定胸部的质药理学和流感病毒学特质可以表述HIV储存量和病理情节的转变。
回顾过去,我们在COVID-19深入研究当年抛弃静脉镜时域的决定是一个错误。首先,我们现在告诉,当适用适当的保护措施和与生俱来掩体装备时,传染给静脉镜医生和后勤人员的后果非常高4。其次,在药理学持续开放性欠缺之处,我们现在从COVID-19当年的深入研究当年告诉,在更为严重的肠胃损伤当年,淋巴呼吸道完全部都是 (如果有的话) 与外周血当年测量的全部都是身呼吸道指数欠缺之处5,6。淋巴内愈演愈烈的流感病毒学、质药理学或病理学转变必须通过深入研究体内推断出来。在COVID-19时代,主因表述适用替代测量的深入研究,使我们对哮喘发作;也统的表述变得模糊。事例如,所谓的‘细胞因子狂风暴雨cytokine storm’7,夸大肠胃质血栓的病理最重要开放性8,以及广泛流行起来但被彻底否定的更为严重COVID-19 ‘ 亚遗传(subphenotypes)’,取自不够成熟的和动力;也统欠缺的状况因素辨别而衍生的病理状况因素学推断9。再次,已有史家验证,到现阶段为数不多的对COVID-19病患者静脉镜骨头展开特质比对的深入研究,其在阐明SARS-CoV-2的发作;也统欠缺之处兼具革命开放性意味10。
在他们的深入研究当年,Sulaiman等人对142名受到感染SARS-CoV-2的病患者展开了静脉淋巴灌洗(bronchoalveolar lage),并适用互补分子电子技术(complementary molecular techniques)深入研究了下肠胃部的化学物质为数众多 (寄生虫和HIV) 和细胞内致病。通过依靠这些步骤的可靠开放性和病理学家学欠缺之处的测量值,并获取严格判定的病理情节信息,创作者考虑到到了过多病理情节 (遇害或机器润滑延长) 的属于自己分子预报因子1。创作者辨认出,下肠胃部寄生虫的总负担和分类特开放性 (通过静脉淋巴灌洗骨头的分子特质) 是遇害和延长机器润滑的独立自主预报因素。这一属于自己辨认出证实了当年对更为严重肠胃损伤的其他原因的辨别结果11,无论适用传统的基于培育出的电子技术还是咽漆子,都未得到重视:在这个描述符当年,培育出检测到的寄生虫牵头受到感染不仅必须预报过多结果,而且等待时间匹配的上肠胃部为数众多落当年包含的寄生虫为数众多落特质与淋巴骨头相同。虽然一些深入研究试上图将咽和直肠化学物质为数众多与COVID-19的病理特质联;也痛快,但近期的辨认出与先前的报导保持明确,即肠胃化学物质为数众多在测量淋巴流感病毒欠缺之处比食道或较高小肠化学物质为数众多体现更这样一来的作用12。
同样,创作者辨认出SARS-CoV-2HIV储存量 (一个相当有争议的话题) 的临床表现意味完全部都是远大于时域的病理学家位置。虽然淋巴骨头当年的HIV储存量是一个令人信服的发病率预报这两项,但在等待时间匹配的上肠胃部骨头当年并非如此。虽然配对的上、下肠胃部骨头的HIV储存量在病患者之间不存在持续开放性,但相同病理学家胸部的临床表现意味区别肯定了COVID-19医务人员病患者HIV副本的位点特异开放性,以及依赖替代检验的局限开放性。
再次,通过比对静脉淋巴灌洗骨头当年的细胞内质子化,创作者辨认出遇害病患者淋巴当年SARS-CoV-2防体 (防刺突和防-RBD) 浓度较高,且与HIV副本呈负欠缺之处 (适用亚DNA三组RNA展开分析方法)。同样,淋巴酪氨酸的区别,最主要产生流感病毒球蛋白 (IgA和IgG) 所即可DNA的下调,预报了很差的病理结果。因此,与广为流传 (在概念上令人担忧) 的观点显然,创作者为分子和位点特异开放性 (淋巴,alveolar) 提供者了证据,声称HIV特异开放性流感病毒缺陷在展开开放性、非解决开放性肠胃损伤当年体现作用。
综上所述,Sulaiman等人的辨认出相当清楚地概述了COVID-19异质开放性的物理现象。病理结果的转变部分是由淋巴HIV承受、肠胃化学物质为数众多落和适应将开放性淋巴致病欠缺表述的。除了这些辨认出提出的这样一来深入研究疑问 (事例如,这些化学物质和流感病毒淋巴特质是否是均是由更为严重COVID-19的可放射治疗特质,淋巴空隙的寄生虫承受和HIV承受是否是是COVID-19医务人员病患者的可行放射治疗靶标,以及淋巴防SARS-CoV-2流感病毒球蛋白质子化是否是可以从放射治疗上减弱) ,这些辨认出也警告我们:如果我们渴望明了COVID-19等更为严重肠胃部受到感染的药理学原理,深入研究肠胃部本身是不必替代的。
说明了
本次清查适用的检验是在纽约市COVID-19个案首次有所减小期间获取的,处理手段突显了当年的病理实践。与近期COVID-19病患者放射治疗步骤有所相同的其当年一个欠缺之处在于,在第一次有所减小期间,大脑皮层高剂量和瑞德西韦这2种可能会因素下肠胃部化学物质状况的防生素适用率较高。其他防生素,如防生素和消炎药,可能会会因素我们的辨认出,因此我们认为它们是潜在的混杂因素。然而,我们并没辨别到这些防生素的适用与病理结果欠缺之处。事例外的是,尽管Sulaiman等人的高校以 ‘ 有所减小种;也统(surge mode)’ 号召,奥马哈和纽约校区都没造成了医务人员、补给或设备短缺的疑问,启动MV的决定与卫生规格没区别。横断面深入研究设计排除了对该描述符当年化学物质为数众多落或细胞内致病的等待时间动态的评价,这可能会为该哮喘的发作;也统提供者了最重要的见解。对于这些病患者,在没病理指征的情况下展开再一次静脉镜检查将是一项终究,可能会即可要考虑到其他侵扰开放性很小的步骤来深入研究后期的下肠胃部,以及其在心肌梗塞病患者当年随等待时间的年终转变。事例外的是,在3个结果三组的检验获取等待时间上并没风靡病学上的显著区别。分析报告哮喘过程当年较早等待时间点的化学物质信号,对于考虑到到在适用广谱防菇剂当年愈演愈烈的转变也可能会很最重要。此外,本文所给出的下肠胃部检验信息仅限于那些在病理卫生当年给予过静脉镜检查的实验者。因此,非培育出信息偏向于COVID-19病患者,这些病患者虽然病况医务人员,但在哮喘更为严重程度谱当年必须均是由极端值。集当年于后期检验获取等待时间点的清查可能会有充分最主要后期遇害或后期事与愿违关闭MV的病患者。
总而言之,Sulaiman等人在此首次分析报告了适用聪DNA三组和聪酪氨酸三组步骤以及细胞内流感病毒谱对即可要侵扰开放性MV的COVID-19医务人员病患者的下肠胃部化学物质三组。RNA聪酪氨酸三组比对(RNA metatranome ysis)显示,SARS-CoV-2的稀土元素与发病率之间不存在相似之处,这与通过靶向rRT-PCR分析报告HIV储存量时辨认出的反馈明确。这些HIV特质与较高的防SARS-CoV-2尖峰IgG以及过多临床表现欠缺之处的下肠胃部细胞内酪氨酸三组特质欠缺之处。最重要的是,通过培育出和NGS信息,Sulaiman等人并没辨认出继发开放性肠胃部流感病毒未经放射治疗受到感染与发病率之间不存在相似之处的证据。总之,这些信息声称,为人所知的下肠胃部SARS-CoV-2副本和SARS-CoV-2特异开放性防体质子化差是即可要MV的COVID-19病患者发病率上升的主要驱动因素。食道常与菇 (如尿液支原体M. salivarium) 的潜在作用即可要进一步探究。M. salivarium 可能会会因素关键性的流感病毒细胞,近期有报导称它在呼吸机获取开放性肠胃炎(ventilator-acquired pneumonia)病患者当年患病率很高。关键性的是,Sulaiman的深入研究团队辨认出SARS-CoV-2回避和/或偏离了有效性的固有/适应将开放性流感病毒反之亦然,这声称旨在控制HIV副本或诱导靶向防HIV流感病毒反之亦然的放射治疗可能会是即可要侵扰开放性MV的SARS-CoV-2受到感染住院病患者一些有愿意的步骤。
参考文献
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