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单细胞基因表达入门之实验工程建设指南

2025-05-08 软件

为什么要进行单细胞核基因强调数据分析?

拉出传统的基因强调数据分析,逐一细胞核地表征细胞核社会群体,细胞核类型和细胞核静止状态等数据

即使如此,各种生物、第一组织和疟疾静止状态当中的基因强调差异现在可以为了让多种方法来鉴定,比如芯片和大量细胞核的RNA分子生物学(RNA-seq)。这些方法通常并不需要数百至数百万个细胞核作为在在材料,但是根本无法得不到整个细胞核社会群体的超过数据。胚胎发育药理学、癌症、神经科学、免疫学和传染病当中的复杂药理学过程并不一定就其到多个单细胞核,它们具不同的细胞核爱人、静止状态和功能。对于这些动态的细胞核事件,大量细胞核的检查根本无法提供者有限的数据,因为单个细胞核的数据现在淹在其当中(Griffiths J.A. et al, Mol Syst Biol, 2018)(由此可知1)。

最近,单细胞核转录第一组核心技术,之外我们的数据采集Chromium单细胞核基因强调解决方案(Chromium Single Cell Gene Expression Solution),很难在单细胞核水平上直接测定基因强调,从而定量细胞核内的社会群体值得注意,并逐一鉴定细胞核类型、细胞核静止状态和动态细胞核跃迁。除了上半年鉴定新的细胞核甲型和罕有细胞核社会群体,单细胞核核心技术还能更好地探究转录动态和基因调节彼此间。

尽管在单细胞核RNA-seq和大量细胞核强调实验者当中,每个结果显示所分子生物学的转录本数目是相同的,但单细胞核基因强调研究可以让您从传统的整体遥相呼应基因数据分析延伸到细胞核类型或细胞核静止状态的鉴定以及伴随的调节通路当中动态变化的鉴定,这是由多个基因驱动的。重要的是,单细胞核基因强调还能充分为了让细胞核社会群体的无特别强调鉴定,而不并不需要细胞核甲型或细胞核遥相呼应的任何客体科学知识。为了借助于单细胞核转录第一组核心技术所带来的丰富科学知识,您在第一次开始实验者在此之前必要考虑有关实验者设计、结果显示制备和北岸数据数据分析的一些特别步骤。

本指南将帮助您卓有成效单细胞核基因强调实验者,并充当路线由此可知,帮助您设计实验者,优化实验者值,并确定数值/数据分析工具,以便更好地数据分析您的单细胞核基因强调数据。

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